In Metroid Prime avremo bisogno di tutte le espansioni per finire il gioco al 100%. Senza rivelarne l'esatta locazione, ecco un semplice ma utile elenco per sapere perlomeno in quali stanze si trovano:

Espansioni Missili

Rovine Chozo
- Sala Totemica;
- Galleria (x2);
- Ingresso alla sala allagata;
- Sala inceneritore;
- Vivaio;
- Santuario  (x2);
- Generatore (x2);
- Sala Quadra;
- Piazza Maestra  (x3);
- Sala Adunata;
- Fontana;
- Navata;
- Sala Allagata;
- Fornace;
- Ingresso Palestra.

Phendrana
- Laboratorio Etere;
- Laboratorio Idra;
- Rovine Ghiacciate Est  (x2);
- Lago Di Phendrana  (x2);
- Grotta dei Ghiacci;
- Saletta di Quarantena;
- Camera di Gravita'.

Superficie Tallon
- Tunnel Ascensore B;
- Area Atterraggio;
- Grotta Vegetazione;
- Camera del Grande Albero;
- Abisso delle Radici;
- Area Impatto Fregata;
- Area di Contenimento Biologico;
- Tunnel per il Bosco Antico;
- Camera Arborea;.

Grotte Magmoor
- Grotta Deposito;
- Mare Lavico;
- Fossa dei Trimastidi.

Miniere di Phazon
- Cava Principale;
- Area di Ricerca Elite;
- Ingresso Sala di Controllo Elite;
- Ingresso Sicurezza A;
- Accesso alle Colture Fungine;
- Coltura Fungina B;
- Quarantena Metroid B.

Serbatoi Energia

Rovine Chozo
- Accesso Ascensore;
- Fornace;
- Piazza Maestra;
- Sala dei Saggi;
- Palestra.

Phendrana
- Cortile Sospeso;
- Laboratorio Etere;
- Ingresso Ascensore.

Superficie Tallon
- Ascensore Cargo per Ponte Gamma;
- Tunnel d'Ingresso Idro.

Grotte Magmoor
- Tunnel Ascensore A;
- Stazione Operativa Magmoor.

Miniere di Phazon
- Pozzo d'Aerazione;
- Ingresso Centro di Lavorazione.

Espansioni Gigabomba

Rovine Chozo
- Cisterna Magmatica.

Phendrana
- Rovine Ghiacciate Ovest;
- Grotta di Sicurezza.

Grotte Magmoor
- Tempio del Guerriero