La maggiore differenza tra  Pokémon Diamante e Pokémon Perla consiste nei “Pokémon esclusivi”. Questi sono dei Pokémon che sono presenti sì in una versione ma sono totalmente assenti nell’altra.
Di seguito la lista dei Pokémon esclusivi delle due versioni.

POKéMON DIAMANTE
Seel
Dewgong
Scyther
Murkrow
Scizor
Larvitar
Pupitar
Tyranitar
Poochyena
Mightyena
Aron
Lairon
Aggron
Kecleon
Cranidos
Rampardos
Honchkrow
Stunky
Skuntank
Dialga

POKéMON PERLA
Slowpoke
Slowbro
Pinsir
Slowking
Misdreavus
Houndour
Houndoom
Stantler
Spheal
Sealeo
Walrein
Bagon
Shelgon
Salamence
Shieldon
Bastiodon
Mismagius
Glameow
Purugly
Palkia

DIFFERENZE FRA MASCHI E FEMMINE

In Pokémon Diamante e Pokémon Perla fra i Pokémon maschi e quelli femmina compaiono delle differenze legate a caratteri dell’aspetto fisico. Per esempio un Pikachu femmina ha la coda che ricorda vagamente la forma di un cuore. Mentre quello maschio no.
Oppure un altro esempio: gli Zubat maschi hanno i denti più lunghi delle Zubat femmine.
Non tutti i Pokémon differiscono nell’aspetto a seconda del sesso.
Nei giochi precedenti non c’erano differenze legate a questo aspetto (riguardante l’aspetto).