Satoru Iwata ha comunicato che, nonostante vecchi rumor che dicevano il contrario, il Wii U sarà compatibile col 3D stereoscopico fin dal lancio. Ad ogni modo, però, ha anche detto che Nintendo non è particolarmente interessata a questa tecnologia, quindi è molto probabile che per dei giochi con il supporto al 3D dovremo aspettare le terze parti.