CORNERIA - Il primo livello del gioco: trattasi della città natia di Fox e compagni, una grande e rigogliosa metropoli circondata da verdi prati, ora ridotta in rovina dalla guerra;

 METEO - Uno dei livelli più suggestivi del gioco, si tratta della cintura di asteroidi che circonda Corneria; il livello si svolge nello spazio, in mezzo ai meteoriti e alle stelle;

 FORTUNA - Un altro pianeta del sistema Lylat; niente di particolare da riscontrare, non è un livello indimenticabile;

 SECTOR X - E' un altro livello affascinante e suggestivo. Si svolge in pieno spazio, come Meteo, in mezzo a relitti di astronavi e grosse lamiere arrugginite; ma anche se tutto sembra calmo e abbandonato, il nemico è in agguato...

 TITANIA - Un altro pianeta del sistema Lylat, caratterizzato da un deserto rosso e infuocato. Tutto è desolato, e non c'è traccia di vita. E' il primo livello dove dovremo usare il Landmaster;

 BOLSE - Un'importante base del sistema Lylat, dove si trova un gosso satellite che Fox e compagni devono distruggere. Lo Starwolf vi aspetta;

 KATINA - Un livello che si svolge nel bel mezzo di una guerra; lo Starfox avrà altre navi dalla sua parte, e dopo aver fatto fuori una decina di nemici, verrà fuoi il boss;

 SOLAR - Un pianeta infuocato e inospitale, simile al nostro sole. Le temperature sono altissime, e ondate e sbuffi di lava mettono continuamente in pericolo la squadra Starfox. Un posto davvero terribile!

 MACBETH - Un livello assai particolare, che si svolge a fianco di un treno;

 SECTOR Y - Un altro livello in pieno spazio, dove dovremo combattere robot volanti e nemici che aspettano dietro ogni angolo;

 AQUAS - Un pianeta completamente sommerso dal mare; per svolgere questa missione dovremo scendere nelle profondità degli abissi più bui e farci largo con il Bluemarine. Un livello molto difficile;

 ZONESS - Un livello molto difficile, che viene poco prima di Venom, dove lo Starfox è seriamente minacciato di finire disintegrato. I nemici si accaniranno particolarmente contro Slippy e Peppy;

 SECTOR Z - Una vera e propria guerra. Si tratterà di difendere la Great Fox da orde di nemici velocissimi, che sbucano da ogni angolo e che sparano anche dei missili contro la nostra nave madre;

 AREA 6 - Un'importante base, sede di satelliti e sistemi di controllo del pianeta Venom. Essa ricorda nell'aspetto ambienti visti nei film di Star Wars, e ad un certo punto lo Starwolf verrà per romperci le uova nel paniere, cercando di difendere l'avamposto.

 VENOM - Il livello finale del gioco. Venom è il pianeta più inospitale e tossico dell'intero sistema Lylat, e ricorda molto Marte. Andross vi ha costruito la sua base, e ci abita da quando è stato esiliato: è qui che ha organizzato il suo esercito e lo ha scagliato contro Corneria.